对于很多种马场而言，身价昂贵的种公马是支撑起马场生意大头的核心资产。由于马匹体内激素、荷尔蒙等原因，大多情况下公马无法竞赛与配种兼顾，因此当纯血马成为种公马时都是已经从赛场退役，不再比赛，等到春天，一般就会被安排其一天多次配种。
当到夏秋，北半球母马不再发情，他们生活就相当于马场里皇帝级别待遇了，24小时专人伺候，不能让种公马过于肥胖，也不可使种公马过于消瘦。
但即便如此，纯血马种公马的留种率也仅有6%左右。因此相对于数量而言，质量显得更为重要。
怎样判断一匹马是否有资格享受“皇帝待遇”？自赛场退役伊始，还没有子孙后代诞生，这时他的价值主要由自身的血统，之前竞赛生涯的比赛成绩来决定。故一匹种公马价值的影因素包括了其本身血统、体型、竞赛成绩。
保证质量的另一方面，在于育种母马。由于一匹种公马每年能配种的母马数量有限，热门的种公马会出现“供不应求”的紧俏局面，这时专业人员对母马进行筛选，只有那些“血统高贵”或者“基因匹配”的母马才能从“海选”中脱颖而出。
等到这些精心配种得来的后代小驹们先后出世，经过四、五年的时间达到竞赛年龄，也就到了种公马们“父凭子贵”的时候了。其后代子嗣冠军数量越多、比例越大，种公马们的身价就会随之上涨。
不过对于纯血马而言，配种中仍有一个大问题——近亲繁殖。种马的流动性不强，特别是历史上一些国家的育马活动只在本国内进行，一段时间下来会造成种群内过度近亲，可选择配种对象减少。例如，一些配种成绩优异的种马，在一段时期大量交配后，如果没有引入新的血统与其后代继续配种，会造成整个父系家族的衰退甚至灭绝。
解决此问题的一个好方法就是种公马穿梭配种。育种母马更多地会选择与当地主流血统不同的种马进行繁育。同时，一匹公马上半年在北半球配种，下半年南下澳大利亚、新西兰再配，物尽其用，也不必有九个月无所事事，最多一年可生二百匹子嗣，每次配种后仍有三四个月回气。
为了纯血赛马优质的父系血脉后继有“马”，能有机会继承辉煌赛绩，人们可谓煞费苦心。